国之重器 · 天蓬工程之羲和高性能计算平台运行一周年产出成果丰硕

近日,国内首个深度面向生命科学领域的高算平台——模式动物重大设施羲和高算平台,自去年5月上线以来已运行近一年。期间,平台运行稳定,性能表现优异,已成为我校师生科研工作的重要支撑。

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截止目前,已累计为校内外43个科研团队提供服务,完成约29万个计算作业、累计使用约390万CPU核时。平台CPU资源日常利用率超过70%,高峰期高达90%。羲和高算平台通过SDWAN技术在涿州与学校校园网连接,从而方便为校内师生提供算力和存储服务。

在生物数据分析方面,羲和高算平台为科研团队提供更充足、更快速的存储空间,让大规模数据应用可以突破带宽、容量、小文件IO的瓶颈。另外,羲和高算平台配备有多种组学加速工具,极大提升了生物信息数据处理能力,平台累计完成5,300多个基因组比对计算加速作业,使用170万CPU核时,与未加速流程相比减少5710万核时使用,计算效率提高30倍以上,为科研团队节省大量计算时间,极大提升了科研成果产出效率。

羲和高算平台上线后迅速成为师生科研工作的重要支撑。据不完全统计,依托平台已产出《Science Advances》、《Molecular Biology And Evolution》等一流及权威期刊论文15篇,几十个国家级科研项目正在其上运行计算任务,对我校生物学、作物学、植物保护、畜牧学等“双一流”学科支撑作用明显。

畜禽生物育种全国重点实验室胡晓湘教授表示,利用羲和高性能计算平台开展高效的多组学计算分析,在鸡的复杂基因组演变、驯化过程解析及重要性状发掘等前沿方向取得了一系列突破进展。大设施“伯乐”遗传平台和羲和算力集群的无缝衔接,完美解决了以前数据拷贝、传输的时间损耗,去年整合伯乐和羲和平台的资源,已完成超12万样本的基因数据分析,也吸引了十余家企事业单位的课题合作开展。在多组学大数据的发展背景下,面对生物数据的指数增长及复杂的计算分析需求,缺乏高效计算支持使得科研计算变得极其困难。羲和高性能计算平台,凭借其强大的计算能力,为解析重要生物学问题及解决种业“卡脖子”问题提供了强有力支撑。

在羲和高算平台运行一年的时间里,大设施建设团队不断降低平台使用的进入门槛,提高集群的计算性能和服务能力,逐步打通测序、影像、细胞、蛋白等重要工艺平台同羲和高算平台的联通,同时为解决算力以及存储不足问题,平台正在进行二期建设,预计下半年扩容完成后计算能力将提升至700TFlops,增长4倍,存储能力提升至15PB,增长14倍,届时平台将为校内师生和科研团队提供更方便、更快捷、更高效、更强大的科研服务综合能力。山有乔松,隰有游龙。“羲和”是上古神话中太阳的车夫,希望“羲和”能够成为科学家的车夫,助力科学家们将辛勤付出产出的科研数据通过运算分析形成耀眼的成果,也欢迎更多师生、科研团队加入到AI、BI、大数据的时代大潮中来。

供稿:模式动物重大设施建设办公室

供图:模式动物重大设施建设办公室

编辑:李杨

责编:孟祥慈

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